29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0253 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0253  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0481  hypothetical protein  84 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1177  cyclic nucleotide-binding protein  72.22 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.886024  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1238  cyclic nucleotide-binding protein  72.22 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103405  normal  0.772826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2659  cupin 2 domain-containing protein  66.67 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2048  cupin 2, barrel  66.67 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2206  hypothetical protein  63.49 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.747866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5970  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.49 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.374591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1663  hypothetical protein  72.55 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.231428  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0826  DSBH domain-containing protein  69.23 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.432318  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0422  hypothetical protein  69.23 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1800  hypothetical protein  69.23 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2513  cupin domain-containing protein  69.23 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2374  cupin domain-containing protein  69.23 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0471  cupin domain-containing protein  69.23 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0656  cupin 2 domain-containing protein  64.29 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0638  cupin 2 domain-containing protein  71.15 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2688  cupin 2 domain-containing protein  63.33 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2706  cupin 2 domain-containing protein  66.07 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4719  cupin domain-containing protein  67.86 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.0255317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5987  cupin domain-containing protein  63.33 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0536952 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0633  hypothetical protein  64.29 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.641228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2580  cupin 2 domain-containing protein  64.29 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4056  cupin 2, barrel  65.38 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.27583  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16440  hypothetical protein  66 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2431  hypothetical protein  58 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2050  DSBH domain-containing protein  54.17 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1160  cupin 2, barrel  55.77 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677962  decreased coverage  0.00806774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1271  cupin 2 domain-containing protein  47.46 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.113842  hitchhiker  0.00655091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>