71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1794 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1794  putative lipoprotein  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1552  putative lipoprotein  82.12 
 
 
183 aa  309  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2929  putative lipoprotein  80.45 
 
 
183 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1770  putative lipoprotein  69.95 
 
 
184 aa  261  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2854  putative lipoprotein  72.56 
 
 
269 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2793  putative lipoprotein  72.12 
 
 
196 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2734  putative lipoprotein  72.12 
 
 
196 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1056  hypothetical protein  61.2 
 
 
185 aa  241  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2130  hypothetical protein  63.39 
 
 
185 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.657299 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1150  hypothetical protein  61.75 
 
 
184 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.35893 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1174  hypothetical protein  61.75 
 
 
202 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0695  hypothetical protein  61.75 
 
 
202 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4286  hypothetical protein  59.78 
 
 
185 aa  238  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1053  hypothetical protein  63.64 
 
 
174 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2770  hypothetical protein  44.5 
 
 
200 aa  177  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.172738  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2191  lipoprotein  47.43 
 
 
180 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.768986  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0673  lipoprotein  46.29 
 
 
182 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2595  putative lipoprotein  47.43 
 
 
180 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2382  lipoprotein  45.71 
 
 
180 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2813  putative lipoprotein  36.99 
 
 
166 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3490  putative lipoprotein  37.57 
 
 
166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212629  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0604  lipoprotein  44.53 
 
 
163 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1840  putative lipoprotein  38.67 
 
 
165 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0582073  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0047  hypothetical protein  39.44 
 
 
164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4089  putative lipoprotein  35.26 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3837  hypothetical protein  42.4 
 
 
189 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139182  normal  0.877225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0959  putative lipoprotein  35.43 
 
 
170 aa  95.5  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0908  putative lipoprotein  34.66 
 
 
173 aa  91.3  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1356  hypothetical protein  34.21 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2222  putative transmembrane protein  37.5 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3111  hypothetical protein  44.32 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2071  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  72  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1899  hypothetical protein  34.17 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  0.292321 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6448  putative lipoprotein  27.06 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.961477  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0268  putative lipoprotein transmembrane  33.67 
 
 
162 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0605  hypothetical protein  33.06 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4200  transmembrane protein  30.77 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1438  lipoprotein transmembrane  33.33 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.565531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1374  putative lipoprotein transmembrane  33.33 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4094  hypothetical protein  32.79 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4746  lipoprotein transmembrane  31.67 
 
 
171 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5584  hypothetical protein  30 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5112  putative lipoprotein transmembrane  25.86 
 
 
166 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4572  putative transmembrane protein  30.51 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.686255  normal  0.728328 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3500  hypothetical protein  30.51 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0357475  normal  0.416536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4052  putative lipoprotein transmembrane  31.09 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1480  lipoprotein transmembrane  32.77 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.028098  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3397  putative lipoprotein transmembrane  31.09 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3222  putative lipoprotein  27.64 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4689  putative lipoprotein transmembrane  30.89 
 
 
167 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1336  putative lipoprotein  26.83 
 
 
183 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130729  normal  0.043389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0832  putative lipoprotein transmembrane  29.55 
 
 
179 aa  54.7  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1021  hypothetical protein  27.5 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1053  putative lipoprotein  27.87 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000833656  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2016  putative lipoprotein  27.64 
 
 
174 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0546155  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2256  hypothetical protein  26.02 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2294  hypothetical protein  26.02 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1644  hypothetical protein  26.02 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2280  hypothetical protein  26.02 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282799  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0404  putative lipoprotein  26.23 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1121  putative lipoprotein  26.23 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1838  putative lipoprotein  26.23 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1427  putative lipoprotein  26.23 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1289  putative lipoprotein  26.23 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1282  putative lipoprotein  26.23 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2173  hypothetical protein  26.02 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0745  putative lipoprotein  26.23 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0954  lipoprotein transmembrane  27.64 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5584  hypothetical protein  25.2 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60834  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0388  putative lipoprotein transmembrane  28.35 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0919  hypothetical protein  27.27 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.600843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>