More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0018 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_R0004  23S ribosomal RNA  83.59 
 
 		 2817 bp  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0023  23S ribosomal RNA  83.59 
 
 		 2816 bp  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0053  23S ribosomal RNA  83.59 
 
 		 2814 bp  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.652954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0076  23S ribosomal RNA  83.63 
 
 		 2798 bp  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0018  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2988 bp  5923    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 3129 bp  636  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 3129 bp  636  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 3129 bp  636  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  83.06 
 
 		 3129 bp  636  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0014  23S ribosomal RNA  83.16 
 
 		 2609 bp  599  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.609994  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0074  23S ribosomal RNA  83.16 
 
 		 2609 bp  599  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00146818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SA  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2902 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145616  hitchhiker  0.000134511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SB  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2902 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  hitchhiker  0.000114916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SC  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2902 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0640928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SD  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2902 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SE  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2902 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564865  normal  0.184682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SF  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2902 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SG  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2902 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0061  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2894 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0096  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2893 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201521  normal  0.459419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0015  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2894 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.832857  normal  0.928468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0002  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2894 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000240791  normal  0.573812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0009  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2893 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.420977  hitchhiker  0.000542144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0094  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2894 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100283  hitchhiker  0.0000146995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0007  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2894 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0077  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2893 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0953932  normal  0.398903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0053  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2893 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.867742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0089  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2894 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0024  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2894 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0002  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2903 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411736  normal  0.431091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0090  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2905 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253032  normal  0.011986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0012  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2903 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0971476  normal  0.0146095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0016  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2893 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.761524  hitchhiker  0.0095644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0019  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2903 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.78193  normal  0.342562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0061  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2905 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0101  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2893 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0044691  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0088  23S ribosomal RNA  82.63 
 
 		 2893 bp  587  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.863469 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0034  23S ribosomal RNA  87.85 
 
 		 2911 bp  579  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0039  23S ribosomal RNA  87.85 
 
 		 2911 bp  579  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0052  23S ribosomal RNA  87.85 
 
 		 2911 bp  579  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0034  23S ribosomal RNA  82.53 
 
 		 2903 bp  579  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0185902  normal  0.779446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0070  23S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 2954 bp  575  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0021  23S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 2954 bp  575  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0021  23S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 2850 bp  575  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.335485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0071  23S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 2850 bp  575  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.764689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0036  23S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 2850 bp  575  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0060  23S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 2954 bp  575  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0055  23S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 2954 bp  575  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0031  23S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 2850 bp  575  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2907 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2908 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2907 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2907 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2907 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2908 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2907 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2907 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2908 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2908 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2907 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2907 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  88.43 
 
 		 2907 bp  571  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2908 bp  563  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2909 bp  563  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2908 bp  563  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2909 bp  563  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2909 bp  563  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2926 bp  563  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2851 bp  563  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2912 bp  563  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2911 bp  563  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2912 bp  563  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0082  23S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 2940 bp  563  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0011  23S ribosomal RNA  82.33 
 
 		 2903 bp  563  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0138586 
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SG  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2908 bp  563  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2908 bp  563  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2908 bp  563  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2908 bp  563  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0031  23S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 2940 bp  563  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0008  23S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 2940 bp  563  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  hitchhiker  0.00128582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>