18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3285 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3285    100 
 
 		 952 bp  1887    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.930868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  98.44 
 
 		 959 bp  1786    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2412    99.89 
 
 		 952 bp  1879    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0606    99.26 
 
 		 951 bp  1824    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1136    89.71 
 
 		 505 bp  79.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0294064  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1156  ISSpo6, transposase OrfB  89.71 
 
 		 531 bp  79.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.279659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1188  ISSpo6, transposase OrfB  89.71 
 
 		 531 bp  79.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1652    89.71 
 
 		 336 bp  79.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441728  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3437  ISSpo6, transposase OrfB  89.71 
 
 		 531 bp  79.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4013  ISSpo6, transposase OrfB  89.71 
 
 		 531 bp  79.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4150    88.24 
 
 		 1234 bp  71.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4262    92.86 
 
 		 958 bp  60  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  92.68 
 
 		 852 bp  58  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  88 
 
 		 955 bp  52  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  85.96 
 
 		 531 bp  50.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  85.96 
 
 		 531 bp  50.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  85.96 
 
 		 531 bp  50.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  85.96 
 
 		 531 bp  50.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>