65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2592 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2592    100 
 
 		 257 bp  509  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.743625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  83.88 
 
 		 321 bp  163  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  85.86 
 
 		 267 bp  157  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  85.86 
 
 		 267 bp  157  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  85.34 
 
 		 267 bp  149  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  82.64 
 
 		 267 bp  139  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  83.51 
 
 		 267 bp  119  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  83.51 
 
 		 267 bp  119  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1568    81.82 
 
 		 266 bp  115  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2497    82.8 
 
 		 1092 bp  107  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0863968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3735  transposase IS3/IS911 family protein  81.03 
 
 		 324 bp  103  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0519    81.91 
 
 		 268 bp  101  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0515    81.91 
 
 		 225 bp  101  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  80.69 
 
 		 267 bp  97.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  80.69 
 
 		 267 bp  97.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  80.69 
 
 		 267 bp  97.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  80.69 
 
 		 267 bp  97.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2385  transposase IS3/IS911 family protein  83.55 
 
 		 213 bp  95.6  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  84.75 
 
 		 303 bp  91.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3393    85.04 
 
 		 304 bp  85.7  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0787  hypothetical protein  83.93 
 
 		 621 bp  79.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0806  hypothetical protein  83.93 
 
 		 804 bp  79.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  85.59 
 
 		 1182 bp  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3396  hypothetical protein  87.32 
 
 		 267 bp  69.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3887    86.49 
 
 		 261 bp  67.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3868    86.49 
 
 		 261 bp  67.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  84.81 
 
 		 267 bp  61.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  84.81 
 
 		 267 bp  61.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  84.81 
 
 		 267 bp  61.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1901  hypothetical protein  86.57 
 
 		 132 bp  61.9  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0434899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4004    82.35 
 
 		 204 bp  60  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2485  integrase, catalytic region  82.35 
 
 		 183 bp  60  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.252644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2475  integrase, catalytic region  82.35 
 
 		 183 bp  60  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0069    83.15 
 
 		 105 bp  58  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 267 bp  56  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 267 bp  56  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  85.29 
 
 		 267 bp  56  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2926  transposase IS3/IS911  88.14 
 
 		 201 bp  54  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1216  ISRSO14-transposase ORFA protein  84.85 
 
 		 264 bp  52  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2406  ISRSO14-transposase ORFA protein  84.85 
 
 		 264 bp  52  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1493  ISRSO14-transposase ORFA protein  84.85 
 
 		 264 bp  52  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0829  ISRSO14-transposase ORFA protein  84.85 
 
 		 264 bp  52  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2967  transposase IS3/IS911  84.85 
 
 		 288 bp  52  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5713    86.21 
 
 		 1992 bp  52  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  86.21 
 
 		 267 bp  52  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  86.21 
 
 		 267 bp  52  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  86.21 
 
 		 267 bp  52  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  86.21 
 
 		 267 bp  52  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  81.19 
 
 		 255 bp  50.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  84.06 
 
 		 264 bp  50.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.623502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  81.19 
 
 		 294 bp  50.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  96.43 
 
 		 267 bp  48.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  96.43 
 
 		 267 bp  48.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  96.43 
 
 		 267 bp  48.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  96.43 
 
 		 267 bp  48.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  96.43 
 
 		 267 bp  48.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  96.43 
 
 		 267 bp  48.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  86.27 
 
 		 267 bp  46.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6117    93.55 
 
 		 105 bp  46.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.692526 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  86.27 
 
 		 267 bp  46.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5642    96.3 
 
 		 1121 bp  46.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5637    96.3 
 
 		 1121 bp  46.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0602  transposase IS3/IS911 family protein  93.55 
 
 		 282 bp  46.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  100 
 
 		 1008 bp  46.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2763  transposase IS3/IS911 family protein  96.3 
 
 		 240 bp  46.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.577864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>