50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0384 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0384  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9907  cell filamentation protein  35.86 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4544  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.48 
 
 		 349 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33143  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.91 
 
 		 203 aa  92.8  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.73 
 
 		 362 aa  92.4  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  31.91 
 
 		 203 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4058  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.98 
 
 		 189 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.89 
 
 		 175 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0151  toxin-antitoxin system, toxin component, Fic family  26.91 
 
 		 239 aa  85.5  9e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.72 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.74 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0913  cell filamentation protein Fic  27.57 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0219  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.18 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  25 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3741  cell filamentation protein Fic  26.47 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  hitchhiker  0.00689442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3644  filamentation induced by cAMP protein Fic  29 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3775  cell filamentation protein Fic  25.98 
 
 		 200 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3838  cell filamentation protein Fic  25.98 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3667  cell filamentation protein Fic  25.98 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.128667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3667  cell filamentation protein Fic  25.98 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0216  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.78 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0351  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.14 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.665169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4671  cell filamentation protein Fic  24.14 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.299298 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3737  cell filamentation protein Fic  24.14 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03212  stationary-phase protein, cell division  24.14 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03164  hypothetical protein  24.14 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.385367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.98 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3558  cell filamentation protein Fic  24.14 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3831  cell filamentation protein Fic  24.14 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0351  cell filamentation protein Fic  24.14 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3643  cell filamentation protein Fic  24.14 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533252  hitchhiker  0.0000580176 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0278  cell division protein  32.56 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0316565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  29.74 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3788  cell filamentation protein Fic  25 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0441  cell filamentation-like protein  29.31 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.701812  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1027  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.57 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000174248  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0721  cell division protein  25.86 
 
 		 199 aa  62  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000102774  normal  0.908113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1983  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.53 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00370142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.14 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3265  filamentation induced by cAMP protein Fic  20.65 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  20.65 
 
 		 194 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0815265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0942  filamentation induced by cAMP protein Fic  20.65 
 
 		 194 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052595  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5579  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.48 
 
 		 432 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117787  normal  0.0799593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  28.32 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6305  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.29 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1523  cell filamentation protein  26.32 
 
 		 202 aa  46.6  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  21.5 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3334  hypothetical protein  29.59 
 
 		 118 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2867  mobilization/cell filamentation proteins-like  24.52 
 
 		 201 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>