27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19440 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_19440  anti-sigma factor, TIGR02949 family  100 
 
 		 113 aa  222  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  42.86 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1108  anti-sigma factor  42.86 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400545  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18560  anti-sigma factor, TIGR02949 family  44.29 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444367  normal  0.815845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2491  anti-sigma factor  38.64 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2383  anti-sigma factor  38.6 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000453147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07710  anti-sigma factor, TIGR02949 family  37.31 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0583122  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1809  anti-sigma factor  36.92 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.847079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2650  hypothetical protein  38.6 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1707  anti-sigma factor  40.32 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.106573  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1409  anti-sigma factor  36.36 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.575969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1779  hypothetical protein  33.85 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09500  anti-sigma factor, TIGR02949 family  40 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.394687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  37.14 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4688  hypothetical protein  32.31 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317438  normal  0.0385147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7736  anti-sigma factor  35.38 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4189  anti-sigma factor  35.71 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3524  anti-sigma factor  38.81 
 
 		 103 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30740  anti-sigma factor, TIGR02949 family  33.33 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1266  anti-sigma factor  35.38 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293532  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 311 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.95 
 
 		 320 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1398  hypothetical protein  30.3 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0698025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1380  hypothetical protein  30.3 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1210  anti-sigma factor  41.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1414  hypothetical protein  30.3 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2178  hypothetical protein  40.98 
 
 		 327 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>