17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  484  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  43.01 
 
 
274 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  40.36 
 
 
278 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  45.34 
 
 
252 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  37.68 
 
 
274 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  40.93 
 
 
257 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10050  hypothetical protein  39.26 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.695793  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  37.04 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  33.48 
 
 
249 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  34.72 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  33.47 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02380  hypothetical protein  34.16 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  31.23 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1967  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0078647  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  29.85 
 
 
285 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  29.85 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6794  hypothetical protein  31.71 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>