40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3178 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3178  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 410 aa  839    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000968255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2685  hypothetical protein  26.28 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2698  hypothetical protein  25.06 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0139158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2728  hypothetical protein  23.87 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.066619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2480  hypothetical protein  23.87 
 
 		 407 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.400243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2663  hypothetical protein  23.87 
 
 		 407 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2442  MerR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 434 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000095607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2678  hypothetical protein  27.11 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000191981 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2411  MerR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2626  hypothetical protein  24.76 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.413901  decreased coverage  0.000000430774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05500  putative transcriptional regulator, MerR family  24.37 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.97959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2139  MerR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 135 aa  47  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  27.78 
 
 		 128 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 		 273 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 139 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 135 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 175 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 145 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 253 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  28.32 
 
 		 132 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 127 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0060  hypothetical protein  33.87 
 
 		 134 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 146 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 127 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 135 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 150 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  28.46 
 
 		 133 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  34.29 
 
 		 148 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 126 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 135 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>