47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3427 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  100 
 
 
129 aa  265  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  44.35 
 
 
125 aa  112  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  41.27 
 
 
128 aa  91.3  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  38.46 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  34.78 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  34.06 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  30.14 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  29.22 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  34.51 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  29.85 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  30 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  31.2 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  27.81 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  27.81 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  32.89 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  28.28 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  29.37 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  28.77 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  28.77 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  29.66 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  28.77 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  28.67 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  29.37 
 
 
149 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  29.37 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  30.19 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  30.86 
 
 
177 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1692  hypothetical protein  28.78 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  28.67 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  33.07 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  26.9 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  27.61 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  32.06 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  27.19 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  27.08 
 
 
146 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  28.47 
 
 
154 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  31.82 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  34.34 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  26.35 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  30.87 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  31.5 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  31.5 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  31.5 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  32.28 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  29.55 
 
 
159 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  31.5 
 
 
158 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  29.55 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  25.17 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.20456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>