13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4705 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4705  HvnC; halovibrin  100 
 
 
324 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2651  HvnA; halovibrin  49.06 
 
 
316 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  43.07 
 
 
507 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4703  hypothetical protein  44.92 
 
 
302 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1888  HvnB; halovibrin  42.81 
 
 
309 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000699147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2507  HvnC; halovibrin  43.68 
 
 
312 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3885  hypothetical protein  44.78 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951156  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39780  hypothetical protein  41.76 
 
 
408 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3370  hypothetical protein  41.13 
 
 
408 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2889  HvnB; halovibrin  41.72 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3886  hypothetical protein  41.16 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2759  hypothetical protein  33.68 
 
 
431 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2758  hypothetical protein  26.9 
 
 
558 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>