13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4703 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4703  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4705  HvnC; halovibrin  40 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3885  hypothetical protein  38.87 
 
 
299 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951156  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2651  HvnA; halovibrin  42.29 
 
 
316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  37.85 
 
 
507 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2889  HvnB; halovibrin  40.37 
 
 
309 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1888  HvnB; halovibrin  34.82 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000699147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3886  hypothetical protein  36.36 
 
 
309 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2507  HvnC; halovibrin  38.15 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39780  hypothetical protein  32.3 
 
 
408 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3370  hypothetical protein  31.94 
 
 
408 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2759  hypothetical protein  32.26 
 
 
431 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2758  hypothetical protein  28.78 
 
 
558 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>