64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0194 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 
234 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  69.66 
 
 
210 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  50.21 
 
 
226 aa  205  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  44.86 
 
 
217 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  46.98 
 
 
180 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  35.85 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  39.55 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  37.31 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  30.34 
 
 
226 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  33.66 
 
 
187 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  35.11 
 
 
211 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  33.94 
 
 
195 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  33.94 
 
 
195 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  35.64 
 
 
211 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  36.41 
 
 
213 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  33.48 
 
 
195 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  33.48 
 
 
195 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  34.59 
 
 
213 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  34.59 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1204  phage baseplate assembly protein V  38.07 
 
 
193 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  41.74 
 
 
213 aa  96.3  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  35.83 
 
 
211 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  34.39 
 
 
194 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  33.53 
 
 
186 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  30.3 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  34.44 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  42.54 
 
 
193 aa  92  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  32.32 
 
 
185 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  32.3 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2218  phage baseplate assembly protein V  31.1 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.033632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  32.99 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  30.49 
 
 
185 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  30.11 
 
 
192 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  30.89 
 
 
187 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  32.16 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  29.25 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  28.81 
 
 
192 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  29.1 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  29.41 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  28.57 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  29.38 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  29.63 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  33.13 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  34.3 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  34.3 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  38.75 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  38.12 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  32.76 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1139  Phage baseplate assembly protein V  38.14 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132402  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1500  Phage P2 baseplate assembly protein GPV-like protein  33.33 
 
 
157 aa  55.1  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2296  baseplate assembly protein V  36.71 
 
 
119 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0236  baseplate assembly protein V, putative  22.6 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2324  hypothetical protein  31.68 
 
 
180 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.711911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2069  hypothetical protein  36.71 
 
 
84 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543099  hitchhiker  0.0000457319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2183  baseplate assembly protein V, truncation  36.71 
 
 
84 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0687  Phage baseplate assembly protein V  28.5 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4960  phage baseplate assembly protein V  26.06 
 
 
172 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  27.37 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  33.33 
 
 
125 aa  48.5  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4546  baseplate  26.84 
 
 
240 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4138  phage baseplate assembly protein V  25.79 
 
 
178 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4545  tail spike  26.84 
 
 
240 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413404  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0590  phage baseplate assembly protein V  25.79 
 
 
189 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2302  phage-related baseplate assembly protein V  26.83 
 
 
145 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>