24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6532 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6532  PE-PGRS family protein  100 
 
 		 1435 aa  2078    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6766  PE-PGRS family protein  99.51 
 
 		 1435 aa  2064    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.682763  normal  0.803816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  47.85 
 
 		 1860 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6354  hypothetical protein  98.63 
 
 		 1166 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00361668  normal  0.829554 
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  46.35 
 
 		 667 aa  184  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  39.32 
 
 		 991 aa  153  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  40.11 
 
 		 828 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  37.76 
 
 		 913 aa  127  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  38 
 
 		 941 aa  121  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2740  hypothetical protein  30.88 
 
 		 668 aa  93.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1866  hypothetical protein  30.88 
 
 		 668 aa  93.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3158  hypothetical protein  31.09 
 
 		 689 aa  92.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3178  hypothetical protein  29.48 
 
 		 628 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  21.74 
 
 		 2487 aa  75.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  18.51 
 
 		 1474 aa  58.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3121  hypothetical protein  31.52 
 
 		 497 aa  56.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  22.59 
 
 		 3296 aa  54.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  18.15 
 
 		 1475 aa  51.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  34.48 
 
 		 533 aa  50.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  20.72 
 
 		 2665 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1284  hypothetical protein  31.03 
 
 		 637 aa  48.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000117205  decreased coverage  0.00000270892 
 
 
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.31 
 
 		 2010 aa  48.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  26.57 
 
 		 877 aa  46.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  34.79 
 
 		 635 aa  45.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>