51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3370 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  710    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  54.35 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  51.4 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  44.01 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  44.17 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  42.16 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  41.24 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  39.12 
 
 		 372 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  41.37 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  43.85 
 
 		 375 aa  222  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  42.47 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  39.36 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  41.62 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5325  hypothetical protein  40.16 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  41.82 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  40 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3484  hypothetical protein  35.71 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  38.23 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  34.81 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  37.78 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  38.78 
 
 		 374 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  34.38 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  35.56 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  34.45 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  32.53 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  33.01 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  29.04 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  29.17 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  27.54 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  31.87 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  27.63 
 
 		 412 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  28.83 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  24.77 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  28.83 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  28.88 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  26.63 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  29.58 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  30.51 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  27.41 
 
 		 373 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  24.06 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  24.46 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  20.56 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  29.35 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  34.47 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  21.71 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  25.44 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  25.39 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  25.55 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  30.17 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  26.7 
 
 		 383 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  29.26 
 
 		 396 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>