36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3039 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3039  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2549  hypothetical protein  58.25 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.763476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0648  hypothetical protein  53.06 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.672224  normal  0.428961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28410  hypothetical protein  51.15 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0702  hypothetical protein  52.94 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2577  hypothetical protein  37.27 
 
 		 167 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000171223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2870  hypothetical protein  36.6 
 
 		 170 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16480  hypothetical protein  41.48 
 
 		 182 aa  84  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.671549  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11372  hypothetical protein  35.43 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1974  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1301  hypothetical protein  37.59 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.322737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2362  hypothetical protein  32.28 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4284  hypothetical protein  30.71 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523579  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  34.15 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  36.54 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.707108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  30.6 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  38.24 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  36.94 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  33.66 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  33.93 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  36.54 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  32.46 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3827  hypothetical protein  31.25 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146373  normal  0.27226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3915  hypothetical protein  31.25 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3841  hypothetical protein  31.25 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0616324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  36.61 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0013  hypothetical protein  36.27 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  31.48 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5399  hypothetical protein  34.82 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  35.78 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  34.38 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0165  hypothetical protein  33.65 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.769455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  30.19 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  29.73 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  32.99 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>