48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2954 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  59.23 
 
 		 279 aa  262  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  42.31 
 
 		 286 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  41.13 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  41.25 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  40.18 
 
 		 281 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  44.31 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  42.93 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  30.99 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  30.13 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  30.13 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  29.71 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  42.13 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  29.71 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  29.29 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  29.03 
 
 		 262 aa  111  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  29.03 
 
 		 262 aa  111  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  43.39 
 
 		 324 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  28.45 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  33.2 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  35.22 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  39.24 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  32.27 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  29.63 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  36.52 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  45.22 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  33.05 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  36.56 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  36 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  32.93 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  35.42 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  35.11 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  35.94 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  39.86 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  34.3 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  33.81 
 
 		 140 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  34.4 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  36.81 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  31.88 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  36.04 
 
 		 268 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  31.64 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  38.68 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 344 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  25.79 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  25.79 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3590  aminoglycoside phosphotransferase  30.14 
 
 		 370 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>