18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1218 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1218  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.995258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2541  hypothetical protein  73.21 
 
 		 63 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09130  hypothetical protein  67.24 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2340  hypothetical protein  64.91 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0734131  hitchhiker  0.0000189619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1855  protein of unknown function DUF343  58.33 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.176655  hitchhiker  0.00737468 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  49.06 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  44.83 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  44.07 
 
 		 57 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  42.37 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3840  hypothetical protein  49.12 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739989  normal  0.0432381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  42.37 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  44.23 
 
 		 64 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2153  hypothetical protein  43.55 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.286356  normal  0.313374 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1098  hypothetical protein  44.9 
 
 		 58 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.647732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  42.37 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  41.67 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  41.67 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>