18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0620 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  253  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  43.7 
 
 		 239 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  56.73 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3371  hypothetical protein  53.4 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  45.74 
 
 		 243 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  38.95 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0325  hypothetical protein  47.14 
 
 		 224 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230791  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  32.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  34.65 
 
 		 262 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  34.13 
 
 		 269 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  34.65 
 
 		 262 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  34.11 
 
 		 250 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  33.33 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  34.96 
 
 		 261 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  35.65 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  30.21 
 
 		 260 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  45.07 
 
 		 448 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  34.96 
 
 		 258 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>