17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0362 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0362  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5296  hypothetical protein  41.05 
 
 
261 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6514  putative ABC transporter integral membrane protein  32.08 
 
 
272 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711681  normal  0.0495934 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1174  hypothetical protein  36.19 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.914249  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1670  hypothetical protein  28.24 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  29.49 
 
 
296 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02620  hypothetical protein  30.67 
 
 
328 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4121  hypothetical protein  27.51 
 
 
263 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  29.46 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0811  hypothetical protein  26.86 
 
 
274 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4079  hypothetical protein  31.25 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.673792  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  37.32 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  34.17 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  28.05 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  30.46 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  31.19 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0054  ABC-type transport system for multi-copper enzyme maturation, permease component  26.29 
 
 
255 aa  42  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>