18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6179 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6179  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5911  hypothetical protein  96.36 
 
 		 330 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.976482  normal  0.67537 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7394  hypothetical protein  85.8 
 
 		 314 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1358  putative glycosyltransferase  70.3 
 
 		 314 aa  454  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3215  putative glycosyl transferase  70.3 
 
 		 314 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3254  putative glycosyl transferase  70.3 
 
 		 314 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3266  hypothetical protein  70.3 
 
 		 314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3270  hypothetical protein  56.5 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1206  hypothetical protein  32.58 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.0226613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3248  putative glycosyltransferase  30.88 
 
 		 290 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.742684 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2601  putative glycosyltransferase  30.88 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3402  hypothetical protein  22.5 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223516  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 385 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  29.69 
 
 		 484 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 404 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 381 aa  43.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 409 aa  42.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>