More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5793 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5793  OsmC family protein  100 
 
 		 166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5576  OsmC family protein  84.94 
 
 		 166 aa  298  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2403  OsmC family protein  70.73 
 
 		 166 aa  248  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.872634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5789  OsmC family protein  71.34 
 
 		 166 aa  247  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301431  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2340  OsmC family protein  70 
 
 		 171 aa  226  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.785611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5560  OsmC family protein  70.12 
 
 		 166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5438  OsmC family protein  65.06 
 
 		 181 aa  222  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6409  OsmC family protein  70.12 
 
 		 166 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0089  OsmC-like protein  64.9 
 
 		 171 aa  197  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5254  OsmC-like protein  62.91 
 
 		 171 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5605  OsmC family protein  62.91 
 
 		 171 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1994  OsmC family protein  59.12 
 
 		 171 aa  191  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4623  OsmC family protein  62.91 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000658892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5326  OsmC family protein  45.39 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1208  OsmC family protein  45 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000524524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3790  peroxiredoxin, Ohr subfamily  47.41 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  42.22 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  42.22 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2167  OsmC family protein  41.79 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  42.22 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1741  OsmC family protein  47.06 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1135  OsmC family protein  44.14 
 
 		 143 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  41.96 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  44.44 
 
 		 141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09146  organic hydroperoxide resistance protein  39.26 
 
 		 141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.851142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1937  peroxiredoxin, Ohr subfamily  42.96 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4604  organic hydroperoxide resistance protein  43.38 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0390709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4559  organic hydroperoxide resistance protein  43.38 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4365  organic hydroperoxide resistance protein  43.38 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4201  organic hydroperoxide resistance protein  43.38 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.675876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4212  organic hydroperoxide resistance protein  43.38 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0469  peroxiredoxin, Ohr subfamily  41.96 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4700  organic hydroperoxide resistance protein  43.38 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4555  organic hydroperoxide resistance protein  43.38 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4586  organic hydroperoxide resistance protein  43.38 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  45.07 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0648  organic hydroperoxide resistance protein  43.38 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  40.85 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4313  OsmC family protein  43.38 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  47.97 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  46.67 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  44.06 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  41.84 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1150  OsmC family protein  40.74 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.283735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  43.61 
 
 		 140 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  41.91 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  43.38 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  47.06 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  47.06 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1954  hypothetical protein  39.72 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1949  hypothetical protein  39.72 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  39.71 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  44.85 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2265  organic hydroperoxide resistance protein, putative  37.76 
 
 		 142 aa  101  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  39.26 
 
 		 140 aa  101  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  41.96 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  39.86 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  42.11 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4973  OsmC family protein  42.54 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  43.61 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  41.48 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5252  OsmC family protein  42.54 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2314  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  38.93 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2927  OsmC-like protein  39.13 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.855798  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4884  OsmC-like protein  42.54 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0898256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  38.57 
 
 		 140 aa  98.6  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  39.86 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  39.26 
 
 		 142 aa  97.8  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3591  OsmC-like protein  41.38 
 
 		 141 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.572762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  40.97 
 
 		 140 aa  97.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  36.57 
 
 		 142 aa  97.4  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1190  organic hydroperoxide resistance protein  41.18 
 
 		 140 aa  97.4  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.481185  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0473  OsmC family protein  39.6 
 
 		 138 aa  97.1  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0482  OsmC family protein  39.6 
 
 		 138 aa  97.1  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0376835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0013  OsmC family protein  41.3 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0338  OsmC family protein  41.67 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  39.13 
 
 		 142 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  37.31 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  39.13 
 
 		 142 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  42.22 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  38.61 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1307  OsmC family protein  41.98 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  40.43 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  42.15 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  39.26 
 
 		 141 aa  95.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  42.11 
 
 		 140 aa  94.7  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0530  OsmC-like protein  38.35 
 
 		 134 aa  94.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  43.75 
 
 		 141 aa  94.4  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0028  OsmC-like protein  40.74 
 
 		 142 aa  94  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.477664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  39.26 
 
 		 142 aa  94  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  39.86 
 
 		 141 aa  94  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0446  OsmC-like protein protein  39.16 
 
 		 146 aa  93.6  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.379428  normal  0.212625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  38.97 
 
 		 142 aa  93.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0432  OsmC-like protein  36.69 
 
 		 134 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3619  OsmC family protein  40.74 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108059  hitchhiker  0.0000417493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  39.86 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  37.5 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  42.65 
 
 		 142 aa  92.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  41.18 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0518  OsmC family protein  38.89 
 
 		 142 aa  91.7  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>