More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5560 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5560  OsmC family protein  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5789  OsmC family protein  84.34 
 
 		 166 aa  294  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301431  normal  0.428964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2403  OsmC family protein  79.52 
 
 		 166 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.872634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5793  OsmC family protein  70.12 
 
 		 166 aa  244  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6409  OsmC family protein  75.3 
 
 		 166 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5576  OsmC family protein  67.07 
 
 		 166 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2340  OsmC family protein  64.38 
 
 		 171 aa  224  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.785611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5438  OsmC family protein  59.75 
 
 		 181 aa  207  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0089  OsmC-like protein  59.33 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5254  OsmC-like protein  58.67 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5605  OsmC family protein  58.67 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.440083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1994  OsmC family protein  55.35 
 
 		 171 aa  183  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4623  OsmC family protein  59.33 
 
 		 171 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000658892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  42.47 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  42.47 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  42.47 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0469  peroxiredoxin, Ohr subfamily  43.41 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  42.96 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  45.77 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1150  OsmC family protein  42.55 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.283735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1135  OsmC family protein  42.54 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3790  peroxiredoxin, Ohr subfamily  45.45 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1741  OsmC family protein  46.55 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1208  OsmC family protein  42.97 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000524524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  44.62 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  42.96 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  43.18 
 
 		 141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1937  peroxiredoxin, Ohr subfamily  42.96 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5326  OsmC family protein  41.67 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  48.33 
 
 		 140 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0648  organic hydroperoxide resistance protein  43.94 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  42.86 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  37.32 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4604  organic hydroperoxide resistance protein  43.18 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0390709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4313  OsmC family protein  43.18 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4559  organic hydroperoxide resistance protein  43.18 
 
 		 138 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4365  organic hydroperoxide resistance protein  43.18 
 
 		 138 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4201  organic hydroperoxide resistance protein  43.18 
 
 		 138 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.675876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4212  organic hydroperoxide resistance protein  43.18 
 
 		 138 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4700  organic hydroperoxide resistance protein  43.18 
 
 		 138 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4586  organic hydroperoxide resistance protein  43.18 
 
 		 138 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4555  organic hydroperoxide resistance protein  43.18 
 
 		 138 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.82 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0338  OsmC family protein  41.67 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09146  organic hydroperoxide resistance protein  35.56 
 
 		 141 aa  104  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.851142  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  42.65 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2167  OsmC family protein  36.11 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  40.82 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  42.11 
 
 		 140 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  41.48 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  40.6 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  41.67 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  40.6 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  39.85 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  40.74 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  42.65 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  42.65 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  36.76 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3591  OsmC-like protein  40.69 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.572762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0473  OsmC family protein  39.39 
 
 		 138 aa  99  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  42.11 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0482  OsmC family protein  39.39 
 
 		 138 aa  99  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0376835 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2265  organic hydroperoxide resistance protein, putative  37.59 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0013  OsmC family protein  39.86 
 
 		 142 aa  98.6  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  40.15 
 
 		 141 aa  97.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  42.65 
 
 		 142 aa  97.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  41.18 
 
 		 190 aa  97.4  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1954  hypothetical protein  36.57 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  40.6 
 
 		 141 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  40.85 
 
 		 140 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  38.1 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  42.22 
 
 		 139 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  40.15 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  40 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1949  hypothetical protein  36.57 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  36.62 
 
 		 140 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  39.1 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  36.36 
 
 		 142 aa  96.3  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4884  OsmC-like protein  40.46 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0898256  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4973  OsmC family protein  40.46 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1307  OsmC family protein  40.91 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5252  OsmC family protein  40.46 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  38.06 
 
 		 142 aa  95.5  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  39.1 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  41.04 
 
 		 139 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_007777  Francci3_0028  OsmC-like protein  37.93 
 
 		 142 aa  94.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.477664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1244  OsmC family protein  37.23 
 
 		 144 aa  94.7  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000339163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  38.97 
 
 		 139 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  39.46 
 
 		 141 aa  94.4  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  40.97 
 
 		 139 aa  94.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  41.48 
 
 		 139 aa  94  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  38.1 
 
 		 141 aa  94  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3619  OsmC family protein  40.15 
 
 		 149 aa  94  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108059  hitchhiker  0.0000417493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  39.55 
 
 		 141 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  41.79 
 
 		 139 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2314  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  36.64 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  39.26 
 
 		 140 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  38.81 
 
 		 139 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  41.79 
 
 		 139 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  39.85 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>