293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2871 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  98.19 
 
 
332 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
332 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  90.71 
 
 
369 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  92.88 
 
 
324 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  92.88 
 
 
324 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  92.88 
 
 
324 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  92.26 
 
 
324 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  80.45 
 
 
326 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  80.45 
 
 
326 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  80.45 
 
 
326 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  80.45 
 
 
326 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  77.27 
 
 
354 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  80.45 
 
 
326 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  80.45 
 
 
326 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  76.8 
 
 
323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  76.42 
 
 
323 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  79.68 
 
 
354 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  75.16 
 
 
322 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  53.39 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  53.55 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  54.97 
 
 
339 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  52.06 
 
 
329 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  52.66 
 
 
336 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  43.89 
 
 
329 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  49 
 
 
309 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  42.76 
 
 
321 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  41.12 
 
 
320 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  41.12 
 
 
320 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
320 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
320 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 
324 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  41.12 
 
 
320 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 
324 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 
324 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
320 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
320 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  41.83 
 
 
324 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
320 aa  209  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  40.46 
 
 
320 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 
324 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  44.41 
 
 
319 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  43.97 
 
 
304 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  43.65 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  43.09 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  43.09 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  43.09 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  46.73 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  43.93 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  43.28 
 
 
301 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  43.46 
 
 
322 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  43.14 
 
 
322 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  42.9 
 
 
301 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 
302 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  42.02 
 
 
308 aa  189  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  43.28 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 
304 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  41.23 
 
 
309 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  43.73 
 
 
316 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  41.16 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  32.95 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  34.29 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  33.8 
 
 
327 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  31.27 
 
 
333 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  32.85 
 
 
328 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  30.64 
 
 
333 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  31.49 
 
 
333 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  30.89 
 
 
333 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  30.89 
 
 
333 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  33.65 
 
 
332 aa  105  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  29.81 
 
 
333 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  29.47 
 
 
331 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  27.86 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  24.91 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  24.81 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  25.47 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  29.76 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4534  hypothetical protein  29.19 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  27.19 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  28.88 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  27.19 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  29.84 
 
 
506 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  28.76 
 
 
491 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0681  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.4 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  25.27 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.51 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.52 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0258  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1598  hypothetical protein  27.67 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2080  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
342 aa  67  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29911  hypothetical protein  25.57 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>