21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2583 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2583  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2453  hypothetical protein  97.2 
 
 		 107 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2559  hypothetical protein  73.83 
 
 		 107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1923  hypothetical protein  71.96 
 
 		 107 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2535  hypothetical protein  71.96 
 
 		 107 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00615729  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5866  hypothetical protein  63.55 
 
 		 107 aa  137  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665282  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0760  hypothetical protein  62.62 
 
 		 103 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668684  normal  0.055839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3185  hypothetical protein  42.47 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0257784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0549  hypothetical protein  43.84 
 
 		 103 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0514005 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0947  hypothetical protein  47.83 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.593029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0943  hypothetical protein  47.83 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1096  hypothetical protein  47.83 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410238  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2134  hypothetical protein  47.83 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0209  hypothetical protein  39.24 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  37.97 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4703  hypothetical protein  38.1 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974877 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3626  hypothetical protein  38.1 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0113  hypothetical protein  47.92 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0123409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2164  hypothetical protein  40.38 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619334  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0468  hypothetical protein  32.08 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3766  hypothetical protein  41.3 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>