More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1538 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  39.03 
 
 		 3470 aa  847    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  33.13 
 
 		 4960 aa  744    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  36.84 
 
 		 2174 aa  801    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.93 
 
 		 4317 aa  737    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  35.95 
 
 		 5953 aa  763    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.09 
 
 		 6889 aa  790    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  36.79 
 
 		 7785 aa  701    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.59 
 
 		 4336 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  40.78 
 
 		 1104 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  32.33 
 
 		 3086 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  39 
 
 		 2151 aa  841    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  36.07 
 
 		 2573 aa  710    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  34.93 
 
 		 5929 aa  663    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1616  amino acid adenylation domain-containing protein  90.72 
 
 		 1665 aa  2757    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0177803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.32 
 
 		 3432 aa  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.68 
 
 		 4960 aa  747    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  35.25 
 
 		 8915 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2785  amino acid adenylation domain-containing protein  44.02 
 
 		 1370 aa  710    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  37.51 
 
 		 4136 aa  720    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1180  non-ribosomal peptide synthetase, putative  67.42 
 
 		 1732 aa  2018    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  39.08 
 
 		 3404 aa  686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.99 
 
 		 4968 aa  747    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1943  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  67.47 
 
 		 1741 aa  2022    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  38.02 
 
 		 2155 aa  838    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  38.16 
 
 		 2370 aa  788    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.62 
 
 		 4336 aa  824    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1957  amino acid adenylation  39.86 
 
 		 1136 aa  678    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  34.84 
 
 		 6176 aa  702    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  39.22 
 
 		 2154 aa  858    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  36.67 
 
 		 4747 aa  834    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  34.71 
 
 		 5926 aa  680    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  35.65 
 
 		 9498 aa  736    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  39.24 
 
 		 1114 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  35.71 
 
 		 13537 aa  752    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  37.06 
 
 		 6676 aa  778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  32.46 
 
 		 2867 aa  671    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  34.8 
 
 		 2201 aa  676    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1559  amino acid adenylation domain-containing protein  96.83 
 
 		 1669 aa  2798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203226  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  33.71 
 
 		 3308 aa  766    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  34.07 
 
 		 3498 aa  772    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  35.03 
 
 		 2033 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  36.66 
 
 		 4317 aa  775    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  28.98 
 
 		 2193 aa  663    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  35.32 
 
 		 3942 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4038  amino acid adenylation domain-containing protein  59.5 
 
 		 1659 aa  1768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2088  pyoverdine synthetase D  67.32 
 
 		 1739 aa  2017    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.393572  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  33.1 
 
 		 2581 aa  793    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.93 
 
 		 8646 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  35.05 
 
 		 6072 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  39.08 
 
 		 5213 aa  758    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  36.24 
 
 		 2606 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  36.89 
 
 		 5654 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  38.7 
 
 		 4502 aa  888    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  35.47 
 
 		 5596 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  42.3 
 
 		 1129 aa  687    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  36.16 
 
 		 4882 aa  713    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1597  amino acid adenylation domain-containing protein  87.66 
 
 		 1658 aa  2606    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  36.62 
 
 		 3331 aa  702    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.47 
 
 		 4332 aa  801    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0874  putative non-ribosomal peptide synthetase  67.42 
 
 		 1732 aa  2018    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4787  amino acid adenylation  90.73 
 
 		 1663 aa  2762    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  38.85 
 
 		 4991 aa  835    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  36.95 
 
 		 4037 aa  823    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  40.52 
 
 		 1138 aa  726    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  40.83 
 
 		 1801 aa  746    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.82 
 
 		 1556 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2417  non-ribosomal peptide synthetase, putative  69.26 
 
 		 1772 aa  1395    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  38.43 
 
 		 5328 aa  871    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4073  amino acid adenylation domain protein  69.7 
 
 		 1674 aa  2153    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  36.66 
 
 		 4489 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  35.81 
 
 		 4317 aa  743    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  37.07 
 
 		 4342 aa  784    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  33.59 
 
 		 1569 aa  746    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0526  non-ribosomal peptide synthetase  69.07 
 
 		 1675 aa  2166    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1928  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  67.38 
 
 		 1745 aa  2022    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  34.89 
 
 		 1689 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1161  amino acid adenylation  91.26 
 
 		 1662 aa  2835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  36.04 
 
 		 4317 aa  757    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1538  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 		 1670 aa  3229    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  35.65 
 
 		 6661 aa  716    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  40.45 
 
 		 2878 aa  812    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.62 
 
 		 4342 aa  775    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  36.67 
 
 		 5149 aa  726    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  39.18 
 
 		 2189 aa  933    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  38.83 
 
 		 2448 aa  880    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  37.29 
 
 		 2125 aa  737    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.34 
 
 		 3291 aa  776    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1641  amino acid adenylation domain-containing protein  91.26 
 
 		 1662 aa  2835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  36.71 
 
 		 3639 aa  690    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  38.57 
 
 		 5230 aa  842    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  41.62 
 
 		 2651 aa  714    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  36.65 
 
 		 2845 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  36.33 
 
 		 3432 aa  707    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1624  putative non-ribosomal peptide synthetase  67.36 
 
 		 1732 aa  2014    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134366  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  30.84 
 
 		 1550 aa  751    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  36.68 
 
 		 5467 aa  687    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  35.17 
 
 		 2137 aa  671    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0287  putative non-ribosomal peptide synthetase  67.42 
 
 		 1732 aa  2018    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0997015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  35.2 
 
 		 4383 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  37.6 
 
 		 8914 aa  783    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>