27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0872 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0872  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  320  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0884  hypothetical protein  98.12 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4120  hypothetical protein  89.38 
 
 		 160 aa  289  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000520793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2386  hypothetical protein  85.09 
 
 		 161 aa  273  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1600  hypothetical protein  64.15 
 
 		 162 aa  201  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2933  hypothetical protein  68.66 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2997  hypothetical protein  68.66 
 
 		 165 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.566272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0148  hypothetical protein  68.66 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0998  hypothetical protein  68.66 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2628  hypothetical protein  68.66 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0475  hypothetical protein  67.91 
 
 		 162 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4250  signal peptide protein  51.09 
 
 		 168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4138  putative signal peptide protein  51.09 
 
 		 168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_003296  RS05314  signal peptide protein  47.4 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.450709 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1050  signal peptide protein  29.87 
 
 		 193 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4092  signal peptide protein  29.1 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4532  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxins-like protein  30 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0908  signal peptide protein  31.11 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1023  putative signal peptide protein  29.53 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2904  signal peptide protein  27.66 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1011  hypothetical protein  64 
 
 		 53 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00188665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0327  signal peptide protein  27.69 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2995  hypothetical protein  21.52 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.399401  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0678  redoxin domain-containing protein  22.98 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.118036  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  24.32 
 
 		 176 aa  50.8  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0971  hypothetical protein  67.65 
 
 		 34 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal  0.142812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4145  redoxin domain-containing protein  18.47 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>