36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6210 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6210  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  346  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5878  hypothetical protein  81.07 
 
 
169 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420141  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7034  hypothetical protein  52.87 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.814698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1900  hypothetical protein  50.62 
 
 
170 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.561652 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1488  hypothetical protein  46.79 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1575  hypothetical protein  46.79 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0388  hypothetical protein  46.79 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1297  hypothetical protein  46.15 
 
 
208 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336493  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1451  hypothetical protein  37.34 
 
 
163 aa  131  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218216  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1773  hypothetical protein  38.31 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00362767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1168  hypothetical protein  37.35 
 
 
166 aa  123  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2826  hypothetical protein  41.83 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1025  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1001  hypothetical protein  35.93 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0156409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2125  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1951  hypothetical protein  41.09 
 
 
164 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3353  hypothetical protein  41.09 
 
 
164 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0417516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2357  hypothetical protein  41.09 
 
 
164 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1226  hypothetical protein  41.09 
 
 
164 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2474  hypothetical protein  41.09 
 
 
164 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2316  hypothetical protein  41.09 
 
 
164 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127724  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0230  hypothetical protein  38.17 
 
 
167 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25750  hypothetical protein  38.61 
 
 
159 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0631  hypothetical protein  34.18 
 
 
159 aa  106  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4519  hypothetical protein  35.15 
 
 
166 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541676  normal  0.505408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4387  hypothetical protein  35.15 
 
 
166 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113252  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1156  hypothetical protein  37.67 
 
 
167 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5193  hypothetical protein  36.99 
 
 
167 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0044  hypothetical protein  32.5 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3267  hypothetical protein  32.17 
 
 
163 aa  85.1  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0993  hypothetical protein  31.47 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3351  hypothetical protein  32.86 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.878366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0379  hypothetical protein  28.57 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129584  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0024  hypothetical protein  47.19 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.355297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0017  hypothetical protein  31.39 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000706359  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.82 
 
 
852 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>