45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4351 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4351  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
136 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224239  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3889  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  89.71 
 
 
150 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.97 
 
 
128 aa  194  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097338 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0900  glyoxalase family protein  66.41 
 
 
130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1889  glyoxalase family protein  66.41 
 
 
130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1188  glyoxalase family protein  66.41 
 
 
130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0355  glyoxalase family protein  66.41 
 
 
130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2163  glyoxalase family protein  66.41 
 
 
130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273953  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0264  glyoxalase family protein  66.41 
 
 
130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215438  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1714  glyoxalase family protein  65.62 
 
 
130 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2195  glyoxalase family protein  65.6 
 
 
143 aa  166  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1379  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.59 
 
 
134 aa  150  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1958  hypothetical protein  36.64 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3464  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.87 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441246  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.68 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2710  glyoxalase/bleomycin resistance protein, GloA-like  34.25 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0210  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.88 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0038  hypothetical protein  32.17 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0414  hypothetical protein  37.84 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1779  hypothetical protein  30.08 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0588  putative dioxygenase  36.67 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258406  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3718  hypothetical protein  37.07 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.78 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680123  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.94 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460855  normal  0.230969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0239  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1883  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.19 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3327  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.11232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.503668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0632  hypothetical protein  34.09 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.4 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2863  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.3 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2144  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0592  hypothetical protein  30.84 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2017  hypothetical protein  29.75 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131595  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.19 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.282007  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2172  hypothetical protein  28.3 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0402357  normal  0.019494 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1848  hypothetical protein  29.81 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  decreased coverage  0.0044175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.01 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270643  normal  0.0370599 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.79 
 
 
142 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.91 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1569  glyoxalase family protein  26.19 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.350324  normal  0.579467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>