35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3326 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3326  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.364508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0411  hypothetical protein  28.52 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2921  hypothetical protein  27.24 
 
 		 346 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0476  hypothetical protein  26.73 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2629  hypothetical protein  26.73 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2249  hypothetical protein  29.86 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5732  hypothetical protein  27.08 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5127  hypothetical protein  27.08 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0750788  normal  0.0212804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4491  hypothetical protein  27.02 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0986  hypothetical protein  23.18 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0934  hypothetical protein  27.5 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1846  hypothetical protein  29.25 
 
 		 167 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0440208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1727  hypothetical protein  30.47 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1927  hypothetical protein  30.66 
 
 		 169 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.51585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2329  hypothetical protein  30.66 
 
 		 169 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2497  hypothetical protein  31.82 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2103  hypothetical protein  29.93 
 
 		 169 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1530  hypothetical protein  29.2 
 
 		 168 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1553  hypothetical protein  30.47 
 
 		 167 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1326  hypothetical protein  29.2 
 
 		 168 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0547  hypothetical protein  29.2 
 
 		 168 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0808  hypothetical protein  29.2 
 
 		 168 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2382  hypothetical protein  30.66 
 
 		 168 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0608  hypothetical protein  29.2 
 
 		 168 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1111  hypothetical protein  28.83 
 
 		 167 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2168  hypothetical protein  22.6 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2341  hypothetical protein  29.2 
 
 		 168 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13380  hypothetical protein  29.09 
 
 		 175 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7608  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5072  hypothetical protein  33.81 
 
 		 167 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.106886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0007  hypothetical protein  26.49 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00121916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2253  hypothetical protein  41.51 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1530  hypothetical protein  24.75 
 
 		 464 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.423449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3915  hypothetical protein  24.42 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206189  normal  0.519402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>