42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1268 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1268  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
118 aa  246  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.131105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  95.92 
 
 
194 aa  204  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  96.97 
 
 
192 aa  204  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  91.35 
 
 
196 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  91.35 
 
 
196 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  91.35 
 
 
196 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  86 
 
 
197 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  75.26 
 
 
194 aa  163  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  68.87 
 
 
194 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  74.19 
 
 
201 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  74.19 
 
 
201 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  74.19 
 
 
201 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  64.49 
 
 
194 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  70.65 
 
 
189 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  63.81 
 
 
192 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  69.15 
 
 
198 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  65.22 
 
 
192 aa  142  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  67.39 
 
 
195 aa  136  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  45 
 
 
225 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  45 
 
 
193 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  44 
 
 
208 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  49.02 
 
 
202 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.92 
 
 
215 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  46.07 
 
 
199 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.68 
 
 
194 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  42.86 
 
 
205 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  43.62 
 
 
195 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  40.22 
 
 
194 aa  80.5  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  42.31 
 
 
194 aa  77.4  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  36.17 
 
 
204 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  36.84 
 
 
189 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  36.84 
 
 
189 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
189 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.79 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  35.79 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
190 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.34 
 
 
192 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  36.21 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  39.13 
 
 
203 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  27.55 
 
 
177 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>