29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0921 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0921  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0917  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0981814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1000  hypothetical protein  97.99 
 
 		 200 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0562  hypothetical protein  97.99 
 
 		 199 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.034618  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1041  hypothetical protein  97.99 
 
 		 199 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2263  hypothetical protein  97.49 
 
 		 199 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4154  hypothetical protein  97.49 
 
 		 199 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0434  hypothetical protein  90.95 
 
 		 198 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.733468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0196  hypothetical protein  90.95 
 
 		 198 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2950  hypothetical protein  90.95 
 
 		 200 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2887  hypothetical protein  90.95 
 
 		 198 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0952  hypothetical protein  90.95 
 
 		 200 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2577  hypothetical protein  90.95 
 
 		 198 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2999  hypothetical protein  90.95 
 
 		 198 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1633  hypothetical protein  89.95 
 
 		 198 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3008  hypothetical protein  84 
 
 		 200 aa  314  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439263  normal  0.0175775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0975  hypothetical protein  83.5 
 
 		 200 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0739  hypothetical protein  78.22 
 
 		 202 aa  294  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2577  signal peptide protein  48.39 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0772  putative signal peptide protein  48.44 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253516  decreased coverage  0.00200061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0843  signal peptide protein  48.44 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0902  signal peptide protein  48.21 
 
 		 190 aa  161  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0714  putative signal peptide protein  46.24 
 
 		 189 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  29.31 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  30.56 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  30.68 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>