128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0379 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0358  transposase mutator family protein  92.13 
 
 
1260 bp  1116    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0431  transposase mutator family protein  92.13 
 
 
1260 bp  1116    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0926  transposase mutator family protein  92.13 
 
 
1260 bp  1116    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1103  transposase mutator family protein  92.13 
 
 
1260 bp  1116    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2748  transposase mutator family protein  92.13 
 
 
1260 bp  1116    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3131  transposase mutator family protein  92.13 
 
 
1260 bp  1116    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3279  transposase mutator family protein  92.13 
 
 
1191 bp  1116    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0398  transposase, mutator type  91.92 
 
 
1260 bp  1106    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1201  transposase, mutator type  91.92 
 
 
1260 bp  1106    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1204  transposase, mutator type  91.92 
 
 
1260 bp  1106    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5297  transposase, mutator type  91.92 
 
 
1260 bp  1106    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0379    100 
 
 
844 bp  1673    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1683  transposase, mutator type  91.92 
 
 
1260 bp  1106    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5562  transposase, mutator type  91.92 
 
 
1260 bp  1106    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0356  transposase mutator type  91.3 
 
 
1260 bp  1061    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0909  transposase mutator type  91.66 
 
 
1260 bp  1084    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2936  transposase mutator type  91.42 
 
 
1260 bp  1068    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4726  transposase mutator type  91.81 
 
 
1260 bp  1098    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685507  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4789  transposase mutator type  91.69 
 
 
1260 bp  1090    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4807  transposase mutator type  91.69 
 
 
1260 bp  1090    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370083  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5742  transposase mutator type  91.69 
 
 
1260 bp  1090    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1787  transposase mutator type  92.16 
 
 
1260 bp  1122    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1793  transposase mutator type  92.04 
 
 
1260 bp  1114    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3771    91.92 
 
 
1955 bp  1106    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3772  transposase mutator type  91.92 
 
 
1260 bp  1106    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5449  transposase, mutator type  91.57 
 
 
723 bp  553  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51248  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0339    86.56 
 
 
693 bp  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00102288  hitchhiker  0.00392365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5448  transposase mutator family protein  89.85 
 
 
411 bp  383  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.422886  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1778  transposase  87.35 
 
 
573 bp  325  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0428813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  80.3 
 
 
1248 bp  153  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  80.1 
 
 
1251 bp  147  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  80.1 
 
 
1251 bp  147  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  80.1 
 
 
1251 bp  147  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  80.1 
 
 
1251 bp  147  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  79.95 
 
 
1281 bp  143  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6787    79.95 
 
 
7304 bp  143  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5159  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  79.95 
 
 
1281 bp  143  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  79.95 
 
 
1281 bp  143  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0168  transposase  82.48 
 
 
312 bp  139  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000669712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  80.35 
 
 
1251 bp  131  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  80.35 
 
 
1251 bp  131  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  80.35 
 
 
1251 bp  131  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  80.35 
 
 
1251 bp  131  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  78.97 
 
 
1260 bp  125  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  78.97 
 
 
1260 bp  125  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  78.97 
 
 
1260 bp  125  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  78.97 
 
 
1260 bp  125  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  79.59 
 
 
1251 bp  125  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0338    85.43 
 
 
288 bp  125  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366373  hitchhiker  0.00778397 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  80.06 
 
 
1251 bp  123  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  80.06 
 
 
1251 bp  123  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  79.33 
 
 
1251 bp  117  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  79.33 
 
 
1251 bp  117  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  79.33 
 
 
1251 bp  117  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  79.33 
 
 
1251 bp  117  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0254    79.33 
 
 
2624 bp  117  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  79.33 
 
 
1251 bp  117  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  78.71 
 
 
1236 bp  117  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  79.33 
 
 
1251 bp  117  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6594  transposase mutator type  79.25 
 
 
888 bp  109  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771123  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  78.81 
 
 
1251 bp  101  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  78.81 
 
 
1251 bp  101  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  80.75 
 
 
1278 bp  97.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  80.75 
 
 
1278 bp  97.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3212  transposase, mutator type  81.38 
 
 
1224 bp  95.6  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3613  transposase, mutator type  81.38 
 
 
1128 bp  95.6  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230884  normal  0.701856 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3615  transposase, mutator type  81.38 
 
 
1224 bp  95.6  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0142    88.24 
 
 
297 bp  91.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890396  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  83.03 
 
 
1236 bp  89.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  83.03 
 
 
1236 bp  89.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  80.28 
 
 
1278 bp  89.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  80.28 
 
 
1278 bp  89.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3387  transposase, mutator type  80.85 
 
 
1224 bp  87.7  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0287  transposase, mutator type  80.85 
 
 
1224 bp  87.7  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0776  transposase, mutator type  80.85 
 
 
1224 bp  87.7  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0805  transposase, mutator type  80.85 
 
 
1224 bp  87.7  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0817  transposase  82.41 
 
 
711 bp  85.7  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3247  transposase, mutator type  81.01 
 
 
1224 bp  85.7  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0371    84.07 
 
 
686 bp  81.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.643844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  89.86 
 
 
1278 bp  81.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  81 
 
 
1224 bp  79.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  79.3 
 
 
1251 bp  77.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2905  transposase mutator type  94 
 
 
1308 bp  75.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.482411  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5439  transposase mutator type  78.81 
 
 
1221 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2219  hypothetical protein  88.41 
 
 
237 bp  73.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0871    78.46 
 
 
537 bp  71.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297306  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6034  transposase mutator type  90 
 
 
1203 bp  71.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0363265  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6091    90 
 
 
1196 bp  71.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2299    85.71 
 
 
512 bp  71.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0127428 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2550a    84.88 
 
 
855 bp  67.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  82.41 
 
 
1269 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  82.41 
 
 
1833 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0625  transposase mutator family protein  82.41 
 
 
873 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1082  transposase mutator family protein  82.41 
 
 
1269 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319318  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1528  transposase mutator family protein  82.41 
 
 
1269 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1744  transposase mutator family protein  82.41 
 
 
681 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.217675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2348  transposase mutator family protein  82.41 
 
 
1269 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2892  transposase mutator family protein  82.41 
 
 
1269 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3138  transposase mutator family protein  82.41 
 
 
1269 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66274  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3244  transposase mutator family protein  82.41 
 
 
1269 bp  63.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.625679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>