More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5448 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1793  transposase mutator type  98.52 
 
 
419 aa  274  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1787  transposase mutator type  98.52 
 
 
419 aa  274  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452427 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5448  transposase mutator family protein  100 
 
 
136 aa  274  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.422886  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0356  transposase mutator type  97.04 
 
 
419 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0909  transposase mutator type  97.04 
 
 
419 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2936  transposase mutator type  97.04 
 
 
419 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0358  transposase mutator family protein  95.56 
 
 
419 aa  268  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0431  transposase mutator family protein  95.56 
 
 
419 aa  268  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0926  transposase mutator family protein  95.56 
 
 
419 aa  268  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1103  transposase mutator family protein  95.56 
 
 
419 aa  268  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2748  transposase mutator family protein  95.56 
 
 
419 aa  268  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3131  transposase mutator family protein  95.56 
 
 
419 aa  268  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4726  transposase mutator type  94.81 
 
 
419 aa  267  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685507  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5562  transposase, mutator type  94.81 
 
 
419 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3772  transposase mutator type  94.81 
 
 
419 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0398  transposase, mutator type  94.81 
 
 
419 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1201  transposase, mutator type  94.81 
 
 
419 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1204  transposase, mutator type  94.81 
 
 
419 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5297  transposase, mutator type  94.81 
 
 
419 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1683  transposase, mutator type  94.81 
 
 
419 aa  266  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3279  transposase mutator family protein  95.56 
 
 
396 aa  266  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5742  transposase mutator type  94.81 
 
 
419 aa  266  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4789  transposase mutator type  94.81 
 
 
419 aa  266  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4807  transposase mutator type  93.33 
 
 
419 aa  263  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370083  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1778  transposase  88.89 
 
 
190 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0428813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  54.07 
 
 
416 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  53.33 
 
 
416 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  53.33 
 
 
416 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  53.33 
 
 
416 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  53.33 
 
 
416 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  55.88 
 
 
419 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  55.88 
 
 
419 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  55.88 
 
 
419 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  55.88 
 
 
419 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  52.59 
 
 
416 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  52.59 
 
 
416 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  52.59 
 
 
416 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  52.59 
 
 
416 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  53.33 
 
 
416 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  53.33 
 
 
416 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  51.85 
 
 
416 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  51.85 
 
 
416 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  51.8 
 
 
426 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  51.8 
 
 
426 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  51.8 
 
 
426 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  51.11 
 
 
416 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  51.11 
 
 
416 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  51.11 
 
 
416 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  51.11 
 
 
416 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  51.11 
 
 
416 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  51.11 
 
 
416 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  51.77 
 
 
411 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  51.77 
 
 
411 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  51.08 
 
 
415 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  50.37 
 
 
416 aa  135  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  50 
 
 
425 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  51.61 
 
 
416 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  53.68 
 
 
415 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  50 
 
 
425 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  50 
 
 
425 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  50 
 
 
425 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  50 
 
 
425 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  51.11 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8282  transposase for insertion sequence element isrm3  49.14 
 
 
406 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2433  transposase mutator type  52.59 
 
 
408 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226553  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  54.35 
 
 
422 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1082  transposase mutator family protein  54.35 
 
 
422 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2892  transposase mutator family protein  54.35 
 
 
422 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  50.53 
 
 
408 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2349  transposase mutator family protein  49.58 
 
 
252 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3138  transposase mutator family protein  54.35 
 
 
422 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  50.53 
 
 
408 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0139  transposase mutator family protein  51.02 
 
 
146 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0287  transposase, mutator type  55.91 
 
 
407 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286188  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3244  transposase mutator family protein  53.26 
 
 
422 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.625679  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3212  transposase, mutator type  55.91 
 
 
407 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3247  transposase, mutator type  55.91 
 
 
407 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203349  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3615  transposase, mutator type  55.91 
 
 
407 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3613  transposase, mutator type  54.74 
 
 
375 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230884  normal  0.701856 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  52.63 
 
 
407 aa  100  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2348  transposase mutator family protein  53.26 
 
 
422 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22340  transposase  42.48 
 
 
449 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  42.48 
 
 
449 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  42.48 
 
 
449 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  42.48 
 
 
449 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  54.74 
 
 
407 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  54.74 
 
 
407 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  42.48 
 
 
449 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  50 
 
 
408 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  50 
 
 
408 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  50 
 
 
408 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  50 
 
 
408 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  50 
 
 
408 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1528  transposase mutator family protein  53.26 
 
 
422 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163505  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  50 
 
 
402 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1379  transposase, mutator type  54.74 
 
 
366 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  50 
 
 
408 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0805  transposase, mutator type  55.43 
 
 
407 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0776  transposase, mutator type  55.43 
 
 
407 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  50 
 
 
408 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>