32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0253 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0253  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0244  hypothetical protein  98.15 
 
 
271 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0325  hypothetical protein  90.15 
 
 
273 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2781  hypothetical protein  90.15 
 
 
273 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0305  hypothetical protein  89.77 
 
 
273 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226888  hitchhiker  0.00040374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3424  hypothetical protein  89.47 
 
 
270 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.993527  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0227  hypothetical protein  84.85 
 
 
274 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.390276  hitchhiker  0.000519653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3102  hypothetical protein  69.02 
 
 
276 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.455016  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0012  hypothetical protein  68.24 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2578  hypothetical protein  68.24 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0007  hypothetical protein  68.24 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0790789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1979  hypothetical protein  68.24 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.887624  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3780  hypothetical protein  68.24 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.384905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3841  hypothetical protein  68.24 
 
 
276 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3116  hypothetical protein  67.2 
 
 
271 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00745763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3532  hypothetical protein  67.2 
 
 
271 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3667  hypothetical protein  54.47 
 
 
270 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0604472  hitchhiker  0.0000000708936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2862  hypothetical protein  52.04 
 
 
271 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0290  hypothetical protein  54.09 
 
 
270 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3031  hypothetical protein  46.62 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3378  hypothetical protein  45.86 
 
 
264 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3211  hypothetical protein  43.14 
 
 
264 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3374  hypothetical protein  42.26 
 
 
265 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3094  hypothetical protein  46.09 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0596  hypothetical protein  23.94 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.802642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0571  hypothetical protein  23.94 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0602  hypothetical protein  23.94 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3865  hypothetical protein  23.94 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2800  hypothetical protein  20.28 
 
 
267 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2610  hypothetical protein  20.28 
 
 
267 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2808  hypothetical protein  20.28 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000066869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5277  hypothetical protein  24.82 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.672646  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>