30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2572 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2660  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  564  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2572  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  564  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.544506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1408  hypothetical protein  98.94 
 
 		 282 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.857501  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2519  hypothetical protein  98.94 
 
 		 282 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9704  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3180  hypothetical protein  98.94 
 
 		 282 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2134  hypothetical protein  98.58 
 
 		 282 aa  554  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1959  hypothetical protein  95.74 
 
 		 282 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0936  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  40.79 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.04 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  42.03 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  27.07 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  30 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  33.66 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  37.5 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.52 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  26.21 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.46 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  24.83 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.06 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.24 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.24 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.55 
 
 		 234 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  34.17 
 
 		 398 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 240 aa  42.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>