21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1421 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1421  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  328  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5055  hypothetical protein  53.42 
 
 
169 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0581426 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  32.05 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  29.49 
 
 
143 aa  50.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 
260 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  30.19 
 
 
149 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  30.19 
 
 
149 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  32.43 
 
 
391 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  30.28 
 
 
209 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  30.87 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
225 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
225 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  30.87 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  29.56 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  26.11 
 
 
220 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2300  hypothetical protein  28.45 
 
 
293 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  31.25 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  28.57 
 
 
220 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  33 
 
 
341 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3711  hypothetical protein  35.14 
 
 
216 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  32.32 
 
 
211 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>