30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1113 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1113  pemK family protein  100 
 
 		 94 aa  194  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1052  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  77.27 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1043  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  76.14 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3386  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  76.14 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0759574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  70.45 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2930  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.89 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.451629  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1792  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.59 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449033 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1390  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.83 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3665  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.05 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0264223  hitchhiker  0.0000119416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0976  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.77 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1919  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.77 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0733  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.31 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515605 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4226  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.5 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1422  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.64 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4051899999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4316  PemK-like protein  39.56 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.649959  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3335  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0793  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.78 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.78 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0310  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.78 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0395146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36390  PemK-like protein  36.78 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1011  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.89 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0829  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.48 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000223685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4772  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.28 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.758226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.26 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0586  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.96 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0376  hypothetical protein  37.66 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1345  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.38 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  31.96 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0832  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.75 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.737175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.9 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>