16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1057 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1057  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  287  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  286  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1326  YhhN family protein  79.72 
 
 
239 aa  199  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  40.15 
 
 
221 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  38.57 
 
 
626 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  39.23 
 
 
597 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  37.69 
 
 
597 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  32.61 
 
 
225 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  38.55 
 
 
236 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  33.33 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  30.66 
 
 
214 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  39.77 
 
 
216 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  29.41 
 
 
234 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  31.3 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  31.3 
 
 
216 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  33.33 
 
 
230 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>