27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2628 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0148  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0998  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2628  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0475  hypothetical protein  99.38 
 
 
162 aa  318  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2933  hypothetical protein  97.58 
 
 
165 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2997  hypothetical protein  96.97 
 
 
165 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.566272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1600  hypothetical protein  83.54 
 
 
162 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4120  hypothetical protein  68.66 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000520793  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0884  hypothetical protein  69.17 
 
 
160 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11048  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0872  hypothetical protein  68.66 
 
 
160 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2386  hypothetical protein  68.66 
 
 
161 aa  185  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05314  signal peptide protein  51.22 
 
 
167 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.450709 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4250  signal peptide protein  49.28 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148773  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4138  putative signal peptide protein  49.28 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1050  signal peptide protein  33.33 
 
 
193 aa  87.4  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0908  signal peptide protein  37.23 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0327  signal peptide protein  32.47 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2995  hypothetical protein  25.16 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.399401  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4092  signal peptide protein  31.78 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2904  signal peptide protein  27.46 
 
 
175 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1023  putative signal peptide protein  28.47 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  30.28 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0678  redoxin domain-containing protein  21.38 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.118036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4532  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxins-like protein  27.83 
 
 
165 aa  57.4  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1011  hypothetical protein  50 
 
 
53 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00188665  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4145  redoxin domain-containing protein  24.39 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  29 
 
 
377 aa  40.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>