26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1173 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1173  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198365  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  100 
 
 
645 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  99.05 
 
 
661 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0069  peptidase  99.45 
 
 
189 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.342109  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  100 
 
 
605 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  61.88 
 
 
645 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  61.43 
 
 
647 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  60.99 
 
 
645 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  60.99 
 
 
647 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  60.99 
 
 
632 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  60.54 
 
 
658 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  64.77 
 
 
602 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  64.77 
 
 
602 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2226  hypothetical protein  100 
 
 
848 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1787  alkyl hydroperoxide reductase, subunit f, truncation  100 
 
 
380 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0415  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0097  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0081  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1521  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1241  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0962  putative lipoprotein  98.21 
 
 
196 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3008  putative lipoprotein  98.21 
 
 
176 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3031  hypothetical protein  98.18 
 
 
222 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433788  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1566  putative lipoprotein  98.18 
 
 
222 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  30.23 
 
 
189 aa  48.9  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  28.7 
 
 
968 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>