21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1837 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1837  fucose permease  100 
 
 		 402 aa  793    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0765737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1651  major facilitator transporter  47 
 
 		 422 aa  349  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0839039  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0874  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.499239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  26.61 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  24.34 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  26.78 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  25 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  29.75 
 
 		 526 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  23.39 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  23.12 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  28.89 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>