20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3082 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2838  ABC transporter permease  88.81 
 
 
420 aa  726    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0117028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2812  ABC transporter, permease  89.05 
 
 
420 aa  727    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.02347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2772  ABC transporter, permease  88.57 
 
 
420 aa  727    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00717003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3053  ABC transporter permease  88.81 
 
 
420 aa  726    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3084  ABC transporter, permease protein  86.9 
 
 
420 aa  711    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3065  ABC transporter, permease protein  89.29 
 
 
420 aa  733    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3082  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
421 aa  844    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2198  ABC transporter, permease protein  65.32 
 
 
421 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000781138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0656  ABC transporter permease  24.23 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0903  ABC transporter, permease  23.4 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3803  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1980  permease domain-containing protein  22.05 
 
 
413 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  22.22 
 
 
412 aa  46.6  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  18.61 
 
 
882 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  22.61 
 
 
656 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  20.45 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  32.47 
 
 
470 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.5 
 
 
820 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.6 
 
 
821 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>