18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0262 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  75.68 
 
 		 308 aa  454  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  63.14 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  61.9 
 
 		 325 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  59.86 
 
 		 322 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  59.04 
 
 		 311 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  57.68 
 
 		 343 aa  335  7.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  58.02 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  54.92 
 
 		 402 aa  331  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  57.68 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  52.33 
 
 		 296 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  41.58 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  33.49 
 
 		 828 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  24.92 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  26.74 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  27.78 
 
 		 918 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  28.57 
 
 		 517 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6836  hypothetical protein  24.32 
 
 		 632 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000213305  normal  0.0288754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>