More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3498 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  71.63 
 
 		 491 aa  704    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  70.8 
 
 		 493 aa  711    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2086  cysteinyl-tRNA synthetase  70.9 
 
 		 488 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.634388  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  74.17 
 
 		 463 aa  710    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 472 aa  968    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  64.03 
 
 		 462 aa  589  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 		 482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  63.07 
 
 		 462 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0670  cysteinyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 506 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0677  cysteinyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 506 aa  554  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 460 aa  552  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2611  cysteinyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 505 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.536822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  62.11 
 
 		 460 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  62.79 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  59.24 
 
 		 477 aa  544  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 		 462 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  62.24 
 
 		 465 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 		 458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1184  cysteinyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 463 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.257527  normal  0.696826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 449 aa  501  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0481  cysteinyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 500 aa  496  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0713  cysteinyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0965  cysteinyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 506 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1038  cysteinyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 588 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 458 aa  445  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 453 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 459 aa  435  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 486 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 486 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4063  cysteinyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1958  cysteinyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.773483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 462 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 459 aa  372  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 467 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 479 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 459 aa  369  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 487 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 462 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 463 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 461 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1390  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 465 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128529  normal  0.023176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 461 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 469 aa  362  7.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 464 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 461 aa  362  9e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 461 aa  362  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  45.01 
 
 		 497 aa  361  1e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  44.63 
 
 		 461 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>