15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3020 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3020  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1755  hypothetical protein  65.27 
 
 		 257 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.147362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1924  hypothetical protein  62.5 
 
 		 263 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139586  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  57.87 
 
 		 270 aa  300  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  61.09 
 
 		 262 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  58.63 
 
 		 261 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2639  hypothetical protein  57.26 
 
 		 276 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1706  hypothetical protein  36.88 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0984595  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1111  hypothetical protein  31.97 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  23.57 
 
 		 265 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  28.06 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  24.53 
 
 		 370 aa  45.4  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  30.47 
 
 		 361 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  25.71 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  25.69 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>