More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0481 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0670  cysteinyl-tRNA synthetase  63.45 
 
 
506 aa  664    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0677  cysteinyl-tRNA synthetase  63.25 
 
 
506 aa  662    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2611  cysteinyl-tRNA synthetase  62.93 
 
 
505 aa  662    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.536822  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0481  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
500 aa  1046    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
463 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2086  cysteinyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
488 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.634388  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
491 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 
493 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
472 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1184  cysteinyl-tRNA synthetase  51 
 
 
463 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.257527  normal  0.696826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0713  cysteinyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
466 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
462 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
477 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
482 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 
460 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0965  cysteinyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
506 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910557  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 
465 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 
588 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
449 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 
462 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1038  cysteinyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
463 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238727  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
458 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
499 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
457 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
449 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
459 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
474 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
462 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
486 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
486 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
474 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1958  cysteinyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
453 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.773483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
461 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4063  cysteinyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
462 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
472 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
459 aa  360  3e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
459 aa  360  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
453 aa  359  6e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
459 aa  353  5e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
467 aa  347  3e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
468 aa  345  8e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
467 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
457 aa  339  5.9999999999999996e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
465 aa  335  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
459 aa  334  2e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
461 aa  333  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
455 aa  332  8e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
458 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
461 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  38.92 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
461 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
459 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
459 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
456 aa  326  7e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
456 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
456 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
485 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
460 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
459 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
459 aa  323  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 
460 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
461 aa  322  9.000000000000001e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
461 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
454 aa  320  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
459 aa  320  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
459 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
461 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
461 aa  319  6e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
459 aa  319  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
459 aa  319  9e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
454 aa  318  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
461 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
488 aa  317  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
470 aa  316  6e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
473 aa  316  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3046  cysteinyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
461 aa  315  8e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 
493 aa  316  8e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
465 aa  315  9e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
487 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
465 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>