12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02808 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02859  predicted inner membrane protein  100 
 
 
449 aa  715    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0713  polysaccharide biosynthesis protein  99.44 
 
 
355 aa  708    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3163  putative polysaccharide biosynthesis protein  99.44 
 
 
449 aa  711    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3450  putative polysaccharide biosynthesis protein  99.72 
 
 
449 aa  713    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0710  polysaccharide biosynthesis protein  99.44 
 
 
449 aa  709    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3268  putative polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
449 aa  714    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.809539  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02808  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  711    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000016091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1689  polysaccharide biosynthesis protein  29.51 
 
 
452 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4577  polysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 
452 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6369  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 
429 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1505  hypothetical protein  24.91 
 
 
440 aa  92.8  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.335604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2493  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 
436 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0697139  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>