27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_52100 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_52100  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  973    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4240  hypothetical protein  41.87 
 
 		 465 aa  295  9e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0163273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0471  hypothetical protein  41.22 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2633  hypothetical protein  38.88 
 
 		 451 aa  276  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.270397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2870  hypothetical protein  40.4 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1435  putative virulence effector protein  43.91 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1882  putative virulence effector protein  41.46 
 
 		 452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1954  hypothetical protein  51.23 
 
 		 517 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.960644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1844  hypothetical protein  51.23 
 
 		 492 aa  170  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2093  putative virulence effector protein  50.53 
 
 		 465 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2381  putative virulence effector protein  46.91 
 
 		 461 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2102  putative virulence effector protein  49.69 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1846  hypothetical protein  50.31 
 
 		 524 aa  157  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.378193  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1748  ssrAB activated gene  43.71 
 
 		 442 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.135386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1773  ssrAB activated gene  43.71 
 
 		 439 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1711  ssrAB activated gene  43.11 
 
 		 441 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1567  ssrAB activated gene  43.11 
 
 		 439 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1708  ssrAB activated gene  43.71 
 
 		 441 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2108  ssrAB activated gene  42.14 
 
 		 460 aa  140  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3155  hypothetical protein  37.93 
 
 		 513 aa  95.9  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0450583  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1312  hypothetical protein  30.34 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00429215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  34.71 
 
 		 597 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0896  hypothetical protein  28.86 
 
 		 421 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.08458  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.09 
 
 		 578 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6478  hypothetical protein  29.67 
 
 		 469 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  28.57 
 
 		 581 aa  47  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1965  hypothetical protein  26.72 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>