16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50420 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_50420  hypothetical membrane protein  100 
 
 
130 aa  254  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01720  hypothetical protein  67.69 
 
 
126 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00570  hypothetical protein  63.72 
 
 
132 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50410  hypothetical membrane protein  43.65 
 
 
134 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00560  hypothetical protein  61.05 
 
 
102 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38580  hypothetical protein  54.95 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04580  hypothetical protein  54.95 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32050  hypothetical protein  50 
 
 
129 aa  94  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33410  hypothetical protein  54.05 
 
 
129 aa  93.6  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35450  hypothetical protein  53.27 
 
 
200 aa  87.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1917  hypothetical protein  37.72 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21050  hypothetical protein  61.82 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2238  hypothetical protein  43.12 
 
 
115 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.644724  normal  0.786116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28060  hypothetical protein  56.94 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31780  hypothetical protein  48.15 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3033  hypothetical protein  45.54 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>